magattacaのブログ

日付以外誤報

お正月読書感想文

素人の、素人による、素人のための読書感想文

RDKit直訳 総括

RDKitドキュメンテーション翻訳の備忘録

Backwards incompatible changes 〜RDKit 直訳 Day25〜

こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 25日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 backward compatibility: 後方互換性 break compatibility: 互換性を破る break down: 分類する 以下、訳 後方…

The RDKit database cartridge 〜RDKit 直訳 Day24〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 24日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 timing information: …

The RDKit Book 〜RDKit 直訳 Day23〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 23日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 electron-contributio…

Miscellaneous Tips and Hints 〜RDKit 直訳 Day22〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 22日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 inertia: 慣性 princi…

Non-Chemical Functionality 〜RDKit 直訳 Day21〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 21日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 binary value: 2進値…

Molecular Fragments 〜RDKit 直訳 Day20〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 20日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 bit ranking function…

Chemical Features and Pharmacophores 〜RDKit 直訳 Day19〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 19日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 Chemical Features: …

Chemical Reactions part2 〜RDKit 直訳 Day18〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 18日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 dummy atom: ダミーア…

Chemical Reactions part1 〜RDKit 直訳 Day17〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 17日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 SMARTS-based languag…

RDKit Cookbook 〜RDKit 直訳 Day16〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 16日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 align: アラインメン…

Descriptor Calculation 〜RDKit 直訳 Day15〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 15日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 Gasteiger partial ch…

Fingerprinting and Molecular Similarity part3 〜RDKit 直訳 Day14〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 14日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 picker: ピッカー sim…

低分子でタンパク質の量を制御 〜アゴニストでもアンタゴニストでも阻害剤でもないMOA〜

創薬 Advent Calendar 2018 - Adventar 13日目が空いていたので埋めます。 創薬アドベントカレンダーを読むような方々には釈迦に説法という感があり恐縮なのですが、しばしお付き合いいただければと思います。 言うまでもありませんが、医薬品となる化合物の…

Fingerprinting and Molecular Similarity part2 〜RDKit 直訳 Day13〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 13日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 Morgan fingerprint: …

Fingerprinting and Molecular Similarity part1 〜RDKit 直訳 Day12〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 12日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 Fingerprinting : フ…

Maximum Common Substructure 〜RDKit 直訳 Day11〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 11日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 SMARTS string: SMART…

Chemical Transformations 〜RDKit 直訳 Day10〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 10日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 core: 骨格 sidechain…

Installation 〜RDKit 直訳 Day9〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 9日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 以下、訳 インストールの仕方(Installation) [L…

Substructure Searching〜RDKit 直訳 Day8〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 8日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 substructure matching…

Working with Molecules part3 〜RDKit 直訳 Day7〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 7日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 pickling machinery : …

Working with Molecules part2 〜RDKit 直訳 Day6〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 6日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 canonical orientation…

Working with Molecules part1 〜RDKit 直訳 Day5〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 5日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 hydrogen atoms implic…

Reading and Writing Molecules part 2 〜RDKit 直訳 Day4〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 4日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 atomic coordinate: 原…

Reading and Writing Molecules part 1 〜RDKit 直訳 Day3〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 3日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 good practice: グッド…

An overview of the RDKit 〜RDKit 直訳 Day2〜

(12/30追記)試訳をまとめたテストサイトを作成しました。よろしければご参照ください。 こちらはRDKit直訳 Advent Calendar 2018 - Adventar 2日目の記事です。基本的な進め方は1日目の記事をご覧ください。 本日の訳出に困った用語 molecular operations:…

RDKit Documentation 翻訳に取り組むにあたって ~RDKit直訳 Day 1~

「RDKitに入門!」と題して、3回にわたりRDKitを使って遊んでみました。非常に便利で、まだまだ素敵な機能がたくさんありそうです。これまでの記事は、完全に「化学の新しいカタチ」さんの記事に負んぶに抱っこという感じで、ひたすらコードをコピー&ペー…

RDKitで3次元構造に挑戦! part 3  〜HALAVENの共結晶構造との比較〜

RDKit とPDB共結晶構造 の3次元構造を比較

RDKitで3次元構造に挑戦! part 2  〜HALAVEN と Halichondrin Bの構造類似性比較〜

RDKit を用いた構造類似性の検証