2020-05-23

TeachOpenCADD トピック１１（パートC）〜オンラインAPI/サービスを使った構造に基づくCADD〜

TeachOpenCADD

ドッキング結果をPLIPで再解析

2020-05-17

オフラインでドッキングする話（T11パートBの備忘録）

TeachOpenCADD

ProteinPlus、ODDT、AutoDockVinaで遊ぶ

2020-05-16

TeachOpenCADD トピック１１（パートB）〜オンラインAPI/サービスを使った構造に基づくCADD〜

TeachOpenCADD

オンラインでドッキングを試みる

2020-05-10

KLIFSで遊んだ話（T11パートAの備忘録）

TeachOpenCADD

KLIFSのWebページとAPIの比較

2020-05-10

TeachOpenCADD トピック１１（パートA）〜オンラインAPI/サービスを使った構造に基づくCADD〜

TeachOpenCADD

複合体をKLIFSで検索し、類似リガンドをPubChemから取得

2020-05-10

Webスクレイピング備忘録（T11 イントロより）

TeachOpenCADD

Webページからテーブルの情報を取得する方法のメモ

2020-05-06

TeachOpenCADD トピック１１（イントロ）〜オンラインAPI/サービスを使った構造に基づくCADD〜

TeachOpenCADD

Webサービスの利用に向けたイントロダクション

2020-05-06

TeachOpenCADD トピック１０ 〜結合サイトの類似性とオフターゲット予測〜

TeachOpenCADD

オフターゲット予測を目的とした同一リガンドに結合するPDB構造の比較

2020-05-05

TeachOpenCADD トピック９ 〜リガンドベースファーマコフォア〜

TeachOpenCADD

RDKitでファーマコフォアモデリング

2020-05-03

TeachOpenCADD トピック８ 〜タンパク質データの取得〜

TeachOpenCADD

PDBの検索とデータの取得、PyMolを使ったアラインメント

2020-05-02

TeachOpenCADD トピック７ 〜リガンドベーススクリーニング〜

TeachOpenCADD

機械学習で活性/不活性を予測