TeachOpenCADD
ドッキング結果をPLIPで再解析
ProteinPlus、ODDT、AutoDockVinaで遊ぶ
オンラインでドッキングを試みる
KLIFSのWebページとAPIの比較
複合体をKLIFSで検索し、類似リガンドをPubChemから取得
Webページからテーブルの情報を取得する方法のメモ
Webサービスの利用に向けたイントロダクション
オフターゲット予測を目的とした同一リガンドに結合するPDB構造の比較
RDKitでファーマコフォアモデリング
PDBの検索とデータの取得、PyMolを使ったアラインメント
機械学習で活性/不活性を予測
最大共通部分構造の探索
クラスタリングで多様な化合物をピックアップ
フィンガープリントで類似度評価
部分構造をもとにデータセットを絞り込む方法
Rule of Fiveによる化合物フィルタリング
ChEMBLからEGFR阻害活性値をもつ化合物データを取得します。
イントロと環境構築の方法について
前置きの前置き